El reconocimiento a aquellos centros que consiguen determinados niveles de mejora del medioambiente, el programa Ecoescuelas contempla la concesión por un periodo de tres años de una distinción, del galardón Bandera Verde de Ecoescuelas, bandera que, con el logotipo del programa, identificará como modelo de calidad educativa a aquellos centros que sean un referente de coherencia ambiental.